原作故事里上帝命令亚伯拉罕牺牲自己的儿子以撒以表忠心。这跟游戏剧情也有关联。游戏开局的旁白给我们讲述了以撒的妈妈如何听到“上帝的声音”，让她以同样的方式献上自己的儿子。
不过不久后，当我们第一次打败妈腿的时候，我们却发现，“以撒的妈妈想杀他，却被上帝阻止”的情节是以撒在画中虚拟的。因为下一个场景我们就看到门的那边，他的妈妈仍然活着。
所以故事又有了新的悬念，我们并不知道以撒的妈妈是不是真的要杀了他。但是故事的第一部分显示，以撒一点都不喜欢他妈妈。他讨厌，甚至说是恨并害怕她。
以撒的结合，在剧情叙述方面，采用了蒙太奇的手法，将13个非常重要的情节，隐藏在了13个结局当中，但他本身并不是平行式的开放结局，他是线性结构的，每一个结局都是揭开下一层的谜面。最开始，以撒从逃避妈妈的追杀，到以撒打败妈妈的腿，以为危机结束，结果画面一转，妈妈持刀破门而入，原来之前的一切都是以撒的绘画在日记中的想象。
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